Project

General

Profile

Download (32.4 KB)

trio_denovo_rule.txt

Nick Ren, 08/17/2016 03:38 PM

 
1 
chromosome	OFFSPRING GENDER	ref allele major	offspring genotype	offspring coverage	mom genotype	mom coverage	dad genotype	dad coverage	FLAG
2 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HET	>=10	NO FLAG
3 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
4 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
5 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
6 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
7 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
8 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
9 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
10 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	DE NOVO
11 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HET	>=10	NO FLAG
12 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
13 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
14 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
15 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	DE NOVO; IN REF
16 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
17 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
18 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
19 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
20 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HET	<10	NO FLAG
21 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
22 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
23 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	<10	NO FLAG
24 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
25 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
26 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	<10	NO FLAG
27 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
28 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY DE NOVO
29 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HET	<10	NO FLAG
30 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
31 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
32 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	<10	NO FLAG
33 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
34 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
35 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	<10	NO FLAG
36 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
37 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
38 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HET	>=10	NO FLAG
39 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
40 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
41 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	>=10	NO FLAG
42 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
43 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
44 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	>=10	NO FLAG
45 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
46 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	POSSIBLY DE NOVO
47 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HET	>=10	NO FLAG
48 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
49 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
50 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	>=10	NO FLAG
51 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
52 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
53 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	>=10	NO FLAG
54 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
55 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
56 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HET	<10	NO FLAG
57 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
58 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
59 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
60 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
61 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
62 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
63 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
64 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY DE NOVO
65 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HET	<10	NO FLAG
66 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
67 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
68 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
69 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
70 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
71 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
72 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
73 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
74 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
75 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
76 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
77 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
78 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
79 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
80 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
81 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
82 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
83 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
84 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
85 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
86 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
87 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
88 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
89 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
90 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
91 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
92 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS
93 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
94 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
95 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
96 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
97 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
98 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
99 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
100 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
101 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
102 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
103 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
104 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
105 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
106 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
107 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
108 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
109 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
110 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS
111 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
112 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
113 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
114 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
115 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
116 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
117 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
118 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
119 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
120 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
121 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
122 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
123 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
124 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
125 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
126 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
127 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
128 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
129 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
130 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
131 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
132 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
133 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
134 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
135 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
136 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
137 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
138 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
139 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
140 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
141 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
142 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
143 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
144 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
145 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
146 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS
147 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
148 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
149 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
150 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
151 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
152 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
153 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
154 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
155 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS
156 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
157 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
158 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
159 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
160 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
161 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
162 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
163 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
164 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	ANY	<10	ANY	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
165 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	ANY	<10	ANY	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
166 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
167 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
168 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
169 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
170 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
171 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
172 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
173 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
174 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
175 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
176 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
177 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
178 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
179 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
180 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
181 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
182 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
183 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
184 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
185 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
186 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
187 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
188 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
189 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
190 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
191 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
192 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
193 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
194 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
195 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
196 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
197 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
198 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
199 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
200 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
201 
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
202 
X	MALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-REF	>=10	ANY	ANY	DE NOVO
203 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	DE NOVO
204 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	DE NOVO; IN REF
205 
X	MALE	YES	HOM-VAR	ANY	HET	>=10	ANY	ANY	NEWLY HEMIZYGOUS
206 
X	MALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-REF	<10	ANY	ANY	NEWLY HEMIZYGOUS OR POSSIBLY DE NOVO
207 
X	MALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	ANY	ANY	NO FLAG
208 
X	MALE	YES	HOM-VAR	ANY	HET	<10	ANY	ANY	POSSIBLY NEWLY HEMIZYGOUS
209 
X	MALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-VAR	<10	ANY	ANY	UNLIKELY NEWLY HEMIZYGOUS
210 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS
211 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS
212 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS
213 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS
214 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
215 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
216 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
217 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
218 
X	MALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-VAR	>=10	ANY	ANY	DE NOVO; IN REF
219 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HET	<10	NO FLAG
220 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
221 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
222 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	<10	NO FLAG
223 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
224 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	<10	NO FLAG
225 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
226 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
227 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HET	>=10	NO FLAG
228 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
229 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
230 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	>=10	NO FLAG
231 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
232 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	>=10	NO FLAG
233 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
234 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
235 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HET	<10	NO FLAG
236 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
237 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
238 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
239 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
240 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
241 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
242 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
243 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HET	>=10	NO FLAG
244 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
245 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
246 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
247 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
248 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
249 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
250 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
251 
X	MALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-VAR	<10	ANY	ANY	NEWLY HEMIZYGOUS OR POSSIBLY DE NOVO; IN REF
252 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
253 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
254 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
255 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
256 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
257 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
258 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
259 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
260 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
261 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
262 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
263 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
264 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
265 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
266 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
267 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
268 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
269 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
270 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
271 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
272 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
273 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
274 
X	MALE	NO	HOM-REF	ANY	HET	>=10	ANY	ANY	NEWLY HEMIZYGOUS; IN REF
275 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HET	<10	NO FLAG
276 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
277 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
278 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	<10	NO FLAG
279 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
280 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
281 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	<10	NO FLAG
282 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
283 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HET	>=10	NO FLAG
284 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
285 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
286 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	>=10	NO FLAG
287 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
288 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
289 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	>=10	NO FLAG
290 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
291 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HET	<10	NO FLAG
292 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
293 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
294 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
295 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
296 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
297 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
298 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
299 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HET	>=10	NO FLAG
300 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
301 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
302 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
303 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
304 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
305 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
306 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
307 
X	MALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-REF	>=10	ANY	ANY	NO FLAG
308 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
309 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
310 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
311 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
312 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
313 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
314 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
315 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
316 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
317 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
318 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
319 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
320 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
321 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
322 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
323 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
324 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
325 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
326 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
327 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
328 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
329 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
330 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY DE NOVO
331 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	POSSIBLY DE NOVO
332 
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY DE NOVO
333 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
334 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
335 
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
336 
X	MALE	NO	HOM-REF	ANY	HET	<10	ANY	ANY	POSSIBLY NEWLY HEMIZYGOUS; IN REF
337 
X	MALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-REF	<10	ANY	ANY	UNLIKELY NEWLY HEMIZYGOUS; IN REF
338 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
339 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
340 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
341 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
342 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
343 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
344 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
345 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
346 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
347 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
348 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
349 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
350 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
351 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
352 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
353 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
354 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
355 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
356 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
357 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
358 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
359 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
360 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
361 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
362 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
363 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
364 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
365 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
366 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
367 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
368 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
369 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
370 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
371 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
372 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
373 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
374 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
375 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
376 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
377 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
378 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
379 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
380 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
381 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
382 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
383 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
384 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
385 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
386 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
387 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
388 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
389 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
390 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
391 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
392 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
393 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
394 
X	MALE	NO	HET	ANY	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO OR NEWLY HEMIZYGOUS; IN REF
395 
X	MALE	NO	HET	ANY	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO OR NEWLY HEMIZYGOUS; IN REF
396 
X	MALE	NO	HET	ANY	HET	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY NEWLY HEMIZYGOUS; IN REF
397 
X	MALE	YES	HET	ANY	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO OR NEWLY HEMIZYGOUS
398 
X	MALE	YES	HET	ANY	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO OR NEWLY HEMIZYGOUS
399 
X	MALE	YES	HET	ANY	HET	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY NEWLY HEMIZYGOUS
400 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
401 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
402 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
403 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
404 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
405 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
406 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
407 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
408 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
409 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
410 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
411 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
412 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
413 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
414 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
415 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
416 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
417 
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
418 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
419 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
420 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
421 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
422 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
423 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
424 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
425 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
426 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
427 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
428 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
429 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
430 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
431 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
432 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
433 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
434 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
435 
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
436 
Y	FEMALE	ANY	ANY	ANY	ANY	ANY	ANY	NA	NO FLAG
437 
Y	MALE  	NO	HET	ANY	ANY	ANY	HET	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
438 
Y	MALE  	NO	HET	ANY	ANY	ANY	HOM-REF	ANY	UNLIKELY DE NOVO
439 
Y	MALE  	NO	HET	ANY	ANY	ANY	HOM-VAR	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
440 
Y	MALE	NO	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	HET	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
441 
Y	MALE	NO	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	HOM-REF	ANY	NO FLAG
442 
Y	MALE	NO	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	HOM-VAR	ANY	DE NOVO; IN REF
443 
Y	MALE  	YES	HET	ANY	ANY	ANY	HET	ANY	UNLIKELY DE NOVO
444 
Y	MALE  	YES	HET	ANY	ANY	ANY	HOM-REF	ANY	UNLIKELY DE NOVO
445 
Y	MALE  	YES	HET	ANY	ANY	ANY	HOM-VAR	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
446 
Y	MALE  	YES	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	HET	ANY	UNLIKELY DE NOVO
447 
Y	MALE  	YES	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	HOM-REF	ANY	DE NOVO
448 
Y	MALE  	YES	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	HOM-VAR	ANY	NO FLAG
449 
MT	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-REF	>=10	ANY	ANY	DE NOVO
450 
MT	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	ANY	HET	>=10	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO
451 
MT	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-REF	<10	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO
452 
MT	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-VAR	>=10	ANY	ANY	NO FLAG
453 
MT	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	ANY	HET	<10	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO
454 
MT	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-VAR	<10	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO
455 
MT	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-VAR	>=10	ANY	ANY	DE NOVO; IN REF
456 
MT	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-VAR	<10	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
457 
MT	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	ANY	HET	>=10	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
458 
MT	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-REF	>=10	ANY	ANY	NO FLAG
459 
MT	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	ANY	HET	<10	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
460 
MT	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-REF	<10	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
461 
MT	MALE OR FEMALE	NO	HET	ANY	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
462 
MT	MALE OR FEMALE	NO	HET	ANY	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
463 
MT	MALE OR FEMALE	NO	HET	ANY	HET	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
464 
MT	MALE OR FEMALE	YES	HET	ANY	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO
465 
MT	MALE OR FEMALE	YES	HET	ANY	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO
466 
MT	MALE OR FEMALE	YES	HET	ANY	HET	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO