Project

General

Profile

trio_denovo_rule.txt

Nick Ren, 08/17/2016 03:38 PM

 
1
chromosome	OFFSPRING GENDER	ref allele major	offspring genotype	offspring coverage	mom genotype	mom coverage	dad genotype	dad coverage	FLAG
2
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HET	>=10	NO FLAG
3
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
4
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
5
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
6
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
7
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
8
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
9
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
10
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	DE NOVO
11
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HET	>=10	NO FLAG
12
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
13
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
14
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
15
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	DE NOVO; IN REF
16
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
17
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
18
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
19
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
20
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HET	<10	NO FLAG
21
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
22
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
23
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	<10	NO FLAG
24
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
25
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
26
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	<10	NO FLAG
27
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
28
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY DE NOVO
29
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HET	<10	NO FLAG
30
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
31
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
32
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	<10	NO FLAG
33
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
34
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
35
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	<10	NO FLAG
36
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
37
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
38
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HET	>=10	NO FLAG
39
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
40
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
41
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	>=10	NO FLAG
42
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
43
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
44
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	>=10	NO FLAG
45
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
46
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	POSSIBLY DE NOVO
47
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HET	>=10	NO FLAG
48
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
49
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
50
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	>=10	NO FLAG
51
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
52
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
53
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	>=10	NO FLAG
54
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
55
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
56
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HET	<10	NO FLAG
57
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
58
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
59
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
60
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
61
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
62
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
63
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
64
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY DE NOVO
65
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HET	<10	NO FLAG
66
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
67
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
68
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
69
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
70
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
71
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
72
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
73
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
74
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
75
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
76
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
77
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
78
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
79
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
80
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
81
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
82
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
83
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
84
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
85
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
86
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
87
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
88
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
89
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
90
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
91
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
92
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS
93
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
94
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
95
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
96
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
97
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
98
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
99
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
100
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
101
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
102
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
103
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
104
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
105
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
106
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
107
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
108
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
109
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
110
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS
111
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
112
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
113
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
114
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
115
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
116
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
117
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
118
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
119
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
120
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
121
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
122
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
123
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
124
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
125
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
126
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
127
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
128
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
129
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
130
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
131
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
132
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
133
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
134
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
135
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
136
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
137
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
138
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
139
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
140
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
141
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
142
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
143
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
144
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
145
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
146
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS
147
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
148
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
149
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
150
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
151
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
152
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
153
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
154
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
155
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS
156
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
157
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
158
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
159
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
160
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
161
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
162
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
163
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
164
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	ANY	<10	ANY	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
165
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	ANY	<10	ANY	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
166
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
167
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
168
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
169
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
170
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
171
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
172
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
173
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
174
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
175
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
176
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
177
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
178
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
179
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
180
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
181
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
182
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
183
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
184
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
185
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
186
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
187
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
188
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
189
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
190
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
191
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
192
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
193
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
194
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
195
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
196
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
197
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
198
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
199
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
200
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
201
AUTOSOME	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
202
X	MALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-REF	>=10	ANY	ANY	DE NOVO
203
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	DE NOVO
204
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	DE NOVO; IN REF
205
X	MALE	YES	HOM-VAR	ANY	HET	>=10	ANY	ANY	NEWLY HEMIZYGOUS
206
X	MALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-REF	<10	ANY	ANY	NEWLY HEMIZYGOUS OR POSSIBLY DE NOVO
207
X	MALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	ANY	ANY	NO FLAG
208
X	MALE	YES	HOM-VAR	ANY	HET	<10	ANY	ANY	POSSIBLY NEWLY HEMIZYGOUS
209
X	MALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-VAR	<10	ANY	ANY	UNLIKELY NEWLY HEMIZYGOUS
210
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS
211
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS
212
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS
213
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS
214
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
215
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
216
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HET	<10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
217
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HET	>=10	NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
218
X	MALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-VAR	>=10	ANY	ANY	DE NOVO; IN REF
219
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HET	<10	NO FLAG
220
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
221
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
222
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	<10	NO FLAG
223
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
224
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	<10	NO FLAG
225
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
226
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
227
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HET	>=10	NO FLAG
228
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
229
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
230
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	>=10	NO FLAG
231
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
232
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	>=10	NO FLAG
233
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
234
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
235
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HET	<10	NO FLAG
236
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
237
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
238
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
239
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
240
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
241
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
242
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
243
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HET	>=10	NO FLAG
244
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
245
X	FEMALE	YES	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
246
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
247
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
248
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
249
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
250
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
251
X	MALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-VAR	<10	ANY	ANY	NEWLY HEMIZYGOUS OR POSSIBLY DE NOVO; IN REF
252
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
253
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
254
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
255
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
256
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
257
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
258
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
259
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
260
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
261
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
262
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
263
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
264
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
265
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
266
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
267
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
268
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
269
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
270
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
271
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
272
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
273
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
274
X	MALE	NO	HOM-REF	ANY	HET	>=10	ANY	ANY	NEWLY HEMIZYGOUS; IN REF
275
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HET	<10	NO FLAG
276
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
277
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
278
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	<10	NO FLAG
279
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
280
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
281
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	<10	NO FLAG
282
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	NO FLAG
283
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HET	>=10	NO FLAG
284
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
285
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
286
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HET	>=10	NO FLAG
287
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
288
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
289
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HET	>=10	NO FLAG
290
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
291
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HET	<10	NO FLAG
292
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
293
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
294
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	<10	NO FLAG
295
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
296
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
297
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
298
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
299
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HET	>=10	NO FLAG
300
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
301
X	FEMALE	NO	HET	NA	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
302
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HET	>=10	NO FLAG
303
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
304
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
305
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
306
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
307
X	MALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-REF	>=10	ANY	ANY	NO FLAG
308
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
309
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	NO FLAG
310
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
311
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	NO FLAG
312
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
313
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	NO FLAG
314
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
315
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	NO FLAG
316
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
317
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
318
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
319
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
320
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
321
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
322
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
323
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
324
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
325
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
326
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
327
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	NO FLAG
328
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
329
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	NO FLAG
330
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY DE NOVO
331
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	POSSIBLY DE NOVO
332
X	FEMALE	YES	HET	NA	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY DE NOVO
333
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
334
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
335
X	FEMALE	NO	HET	NA	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
336
X	MALE	NO	HOM-REF	ANY	HET	<10	ANY	ANY	POSSIBLY NEWLY HEMIZYGOUS; IN REF
337
X	MALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-REF	<10	ANY	ANY	UNLIKELY NEWLY HEMIZYGOUS; IN REF
338
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
339
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
340
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
341
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
342
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
343
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
344
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
345
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
346
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
347
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
348
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
349
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
350
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
351
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
352
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
353
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
354
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
355
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
356
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
357
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
358
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
359
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
360
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
361
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
362
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
363
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
364
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
365
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS
366
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
367
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
368
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
369
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
370
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
371
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
372
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
373
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
374
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
375
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
376
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
377
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
378
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
379
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
380
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
381
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
382
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
383
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
384
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
385
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
386
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
387
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HET	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
388
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
389
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
390
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
391
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
392
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
393
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HET	>=10	POSSIBLY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
394
X	MALE	NO	HET	ANY	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO OR NEWLY HEMIZYGOUS; IN REF
395
X	MALE	NO	HET	ANY	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO OR NEWLY HEMIZYGOUS; IN REF
396
X	MALE	NO	HET	ANY	HET	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY NEWLY HEMIZYGOUS; IN REF
397
X	MALE	YES	HET	ANY	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO OR NEWLY HEMIZYGOUS
398
X	MALE	YES	HET	ANY	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO OR NEWLY HEMIZYGOUS
399
X	MALE	YES	HET	ANY	HET	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY NEWLY HEMIZYGOUS
400
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
401
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
402
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
403
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
404
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
405
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
406
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
407
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
408
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
409
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
410
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
411
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
412
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
413
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
414
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HET	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
415
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
416
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
417
X	FEMALE	YES	HOM-VAR	<10	HET	>=10	HOM-REF	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS
418
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
419
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
420
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
421
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-REF	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
422
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
423
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	<10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
424
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
425
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
426
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
427
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
428
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HET	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
429
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
430
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
431
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-VAR	>=10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
432
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
433
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HET	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
434
X	FEMALE	NO	HOM-REF	<10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
435
X	FEMALE	NO	HOM-REF	>=10	HOM-REF	<10	HOM-VAR	>=10	UNLIKELY NEWLY HOMOZYGOUS; IN REF
436
Y	FEMALE	ANY	ANY	ANY	ANY	ANY	ANY	NA	NO FLAG
437
Y	MALE  	NO	HET	ANY	ANY	ANY	HET	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
438
Y	MALE  	NO	HET	ANY	ANY	ANY	HOM-REF	ANY	UNLIKELY DE NOVO
439
Y	MALE  	NO	HET	ANY	ANY	ANY	HOM-VAR	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
440
Y	MALE	NO	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	HET	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
441
Y	MALE	NO	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	HOM-REF	ANY	NO FLAG
442
Y	MALE	NO	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	HOM-VAR	ANY	DE NOVO; IN REF
443
Y	MALE  	YES	HET	ANY	ANY	ANY	HET	ANY	UNLIKELY DE NOVO
444
Y	MALE  	YES	HET	ANY	ANY	ANY	HOM-REF	ANY	UNLIKELY DE NOVO
445
Y	MALE  	YES	HET	ANY	ANY	ANY	HOM-VAR	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
446
Y	MALE  	YES	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	HET	ANY	UNLIKELY DE NOVO
447
Y	MALE  	YES	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	HOM-REF	ANY	DE NOVO
448
Y	MALE  	YES	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	HOM-VAR	ANY	NO FLAG
449
MT	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-REF	>=10	ANY	ANY	DE NOVO
450
MT	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	ANY	HET	>=10	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO
451
MT	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-REF	<10	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO
452
MT	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-VAR	>=10	ANY	ANY	NO FLAG
453
MT	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	ANY	HET	<10	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO
454
MT	MALE OR FEMALE	YES	HOM-VAR	ANY	HOM-VAR	<10	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO
455
MT	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-VAR	>=10	ANY	ANY	DE NOVO; IN REF
456
MT	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-VAR	<10	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
457
MT	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	ANY	HET	>=10	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
458
MT	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-REF	>=10	ANY	ANY	NO FLAG
459
MT	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	ANY	HET	<10	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
460
MT	MALE OR FEMALE	NO	HOM-REF	ANY	HOM-REF	<10	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
461
MT	MALE OR FEMALE	NO	HET	ANY	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
462
MT	MALE OR FEMALE	NO	HET	ANY	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO; IN REF
463
MT	MALE OR FEMALE	NO	HET	ANY	HET	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO; IN REF
464
MT	MALE OR FEMALE	YES	HET	ANY	HOM-VAR	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO
465
MT	MALE OR FEMALE	YES	HET	ANY	HOM-REF	ANY	ANY	ANY	POSSIBLY DE NOVO
466
MT	MALE OR FEMALE	YES	HET	ANY	HET	ANY	ANY	ANY	UNLIKELY DE NOVO